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利用微生物直接作为农药使用：微生物肥料
自然界中有不少微生物（病毒、细菌、真菌和线虫）具有杀虫、杀菌、除草及植物生物调节活性。这种微生物具有很高的专一性，其对靶标有害物具有极高的选择性，而对其他生物却十分安全。在现今的直接应用的微生物源农药中，以苏云金杆菌（b·t）居主要市场，约占整个微生物源农药的70%以上，其中半数在美国。目前的b·t商品约数百种，可防治百余种有害昆虫。此外，美国的mycogen公司生产的荧光极毛菌、孟山都公司的赛氏杆菌，以及fairfax公司生产的日本金龟子芽孢杆菌等也是已产业化的细菌杀虫剂。同样，在b·t剂的生产与应用也基为广泛，据悉已有50余家工厂从事此药剂的应用开发。同样，采用病毒进行防治虫的研究开发较为广泛。在德国、美国等国家均已开发了不少产品，如苹果蠢蛾颗粒体病毒、舞毒蛾核多角体病毒等。在，也开发了用于防治松毛虫和棉铃虫的核多角病毒，并有少量生产。此外，用真菌治虫也是一个重要方面，如果白僵菌治虫已成为大家所熟知。chr.hansen，koppert等公司亦开发了用轮技孢菌治虫的产品。另外，也有用线虫、原生动物进行防虫治虫的，并已产业化。在杀菌剂方面也出现了不少防治病害的以菌治菌的产品，如kemiraoy公司用于防治真菌病害的细菌产品——mycostop;wrgrace、ecologicallabs、bio—innovation等公司以绿粘帝霉、大隔孢伏革霉、木霉属等真菌来防治各种真菌病害。此外，bio—care公司生产的放射形土壤杆菌、bumsphillips公司生产的荧光极毛杆菌则作为防治各种细菌的细菌产品。同时，也有用真菌产品作为“除草剂”以达到以菌治草的，如ecogen、philom、bios等公司的盘长孢状刺盘孢产品、abbott公司的棕榈疫霉产品均可用于防除杂草。由于人们对微生物源农药的开发兴趣越来越浓厚，近年来又出现了不少新的直接作为农药的微生物原农药。如日本烟草公司开发了用于防除草坪杂草早熟禾的细菌除草剂（xanthomonascapestris）;俄罗期科学院则开发了用于防治蚜虫和红蜘蛛等害虫的细菌性杀虫剂双毒杆菌。英国作物保护学会则于1997年4月举行了一次有关微生物源杀虫剂发展前景的世界性会议。会上，美国胺公司介绍了采自非洲蝎子的工程棒状病毒的田间杀虫效果；英国的天然作物保护公司则介绍生产beauveriabassiana的生产剂型。会议中，充分肯定了微生物源杀虫剂的作用，并肯定了其前景。
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